Ang Genotyping at Phenotyping ay Makatutukoy, at Kahit Maghula, Pagtutol ng Drug ng HIV
Kahit para sa mga taong may pinakamainam na pagsunod sa therapy, ang ilang antas ng paglaban sa HIV na gamot ay inaasahan na lumago sa paglipas ng panahon dahil sa mga natural mutations ng virus. Sa ibang mga kaso, ang paglaban ay maaaring mabilis na lumilikha kapag ang suboptimal adherence ay nagbibigay-daan para sa mga lumalaban na populasyon ng HIV na umunlad, na humahantong sa pagtatapos ng paggamot.
Kapag nangyari ang pagkabigo sa paggamot, ang mga alternatibong mga kumbinasyon ng bawal na gamot ay dapat mapili upang sugpuin ang bagong populasyon ng lumalaban na virus.
Ang pagsubok ng paglaban sa genetiko ay tumutulong na mapadali ito sa pamamagitan ng pagtukoy ng mga uri ng mga mutations na lumalaban sa "viral pool" ng isang tao, habang tinitiyak kung gaano kadali ang mga virus na posible sa mga antiretroviral agent .
Ang dalawang pangunahing mga kasangkapan ay ginagamit para sa genetic resistance testing sa HIV: ang genotypic assay at ang HIV phenotypic assay .
Ano ang Genotype at Phenotype?
Sa pamamagitan ng kahulugan, ang isang genotype ay ang genetiko lamang ng isang organismo, habang ang isang phenotype ay ang kapansin-pansin na mga katangian o katangian ng organismo na iyon.
Ang genotypic assays (o genotyping) function sa pamamagitan ng pagtukoy ng minanang mga tagubilin sa loob ng genetic coding ng isang cell, o DNA. Ang phenotypic assays (o phenotyping) kumpirmahin ang pagpapahayag ng mga tagubilin sa ilalim ng impluwensiya ng iba't ibang mga kondisyon sa kapaligiran.
Bagaman hindi ganap ang kaugnayan ng genotype at phenotype, ang genotyping ay kadalasang maaaring predictive ng phenotype, lalo na kapag ang mga pagbabago sa genetic code ay nagbibigay sa mga inaasahang pagbabago sa mga katangian o katangian-tulad ng kaso ng pagbubuo ng paglaban ng gamot.
Ang phenotyping, sa kabilang banda, ay nagpapatunay sa "dito-at-ngayon." Nilalayon nito na masuri ang reaksyon ng isang organismo sa mga partikular na pagbabago sa presyur sa kapaligiran-tulad ng kapag nahantad ang HIV sa iba't ibang mga gamot at / o mga konsentrasyon sa gamot.
Nagpapaliwanag ng HIV Genotyping
Ang genotyping ng HIV sa pangkalahatan ay ang pinaka-karaniwang teknolohiya na ginagamit para sa paglaban ng pagsubok.
Ang layunin ng esse ay ang tuklasin ang mga tiyak na genetic mutations sa lugar ng gag-pol ng genome ng virus (o genetic code). Ito ang rehiyon kung saan ang reverse transcriptase, protease at integrase enzymes-ang mga target ng karamihan sa mga antiretroviral na gamot -ay naka-encode sa kadena ng DNA.
Sa pamamagitan ng unang pagpapalaki ng HIV genome gamit ang polymerase chain reaction (PCR) na teknolohiya, ang mga technician ng laboratoryo ay maaaring magkakasunod (o "mapa") ang genetika ng virus na gumagamit ng iba't ibang mga teknolohiya ng pagtukoy ng mutasyon.
Ang mga mutation ng thesis (o akumulasyon ng mga mutasyon) ay binibigyang kahulugan ng mga tekniko na nag-aralan ang kaugnayan sa pagitan ng mga kinilala na mutasyon at ang inaasahang pagkamaramdaman ng virus sa iba't ibang antiretroviral drugs. Ang mga database sa online ay maaaring makatulong sa pamamagitan ng paghahambing sa pagkakasunud-sunod ng pagsubok sa isang prototype na "wild-type" na virus (ibig sabihin, ang HIV na naglalaman ng walang mutasyon na lumalaban).
Ang interpretasyon ng mga pagsusuring ito ay ginagamit upang matukoy ang pagkamaramdamin ng droga, na may mas malaking bilang ng mga pangunahing mutasyon na nagbibigay sa mas mataas na antas ng paglaban sa droga .
Nagpapaliwanag ng HIV Phenoytyping
Tinutukoy ng phenotyping ng HIV ang paglago ng HIV ng tao sa pagkakaroon ng isang gamot, at itinutulad nito na ang paglago ng isang kontrol, ligaw na uri ng virus sa parehong gamot.
Tulad ng genotypic assays, ang phenotypic tests ay nagpapalawak ng gag-pol region ng genome ng HIV.
Ang seksyong ito ng genetic code ay pagkatapos ay "grafted" sa isang ligaw-uri clone gamit recombinant DNA teknolohiya . Ang resultang recombinant virus ay ginagamit upang makahawa sa mga selula ng mammalian sa vitro (sa lab).
Pagkatapos ay malantad ang viral sample sa pagtaas ng concentrations ng iba't ibang antiretroviral drugs hanggang 50% at 90% viral suppression ay nakamit. Pagkatapos ay inihahambing ang mga konsentrasyon sa mga resulta mula sa kontrol, sample ng ligaw na uri.
Ang mga kamag-anak na "fold" na mga pagbabago ay nagbibigay ng hanay ng halaga kung saan tinutukoy ang pagiging sensitibo ng gamot. Ang apat na beses na pagbabago ay nangangahulugang apat na beses ang halaga ng gamot na kinakailangan upang makamit ang viral suppression kumpara sa na ng ligaw na uri.
Ang mas malaki ang halaga ng fold, ang mas madaling kapitan ng virus ay isang partikular na gamot.
Ang mga halagang ito ay inilalagay sa loob ng mas mababang clinical at upper-clinical range, na may mataas na halaga na nakabatay sa mas mataas na antas ng paglaban sa droga. (Tingnan ang sample na ulat .)
Kailan Ginagawa ang Pagsubok ng Genetic Resistance?
Sa US, ang pagsubok ng genetic resistance ay ayon sa kaugalian na isinagawa sa paggagamot ng mga pasyente na walang pasubali upang matukoy kung mayroon silang anumang "nakuha" na pagtutol sa droga. Ang mga pag-aaral sa US ay nagpapahiwatig na sa pagitan ng 6% at 16% ng transmitted virus ay lumalaban sa hindi bababa sa isang antiretroviral drug, samantalang halos 5% ay lumalaban sa higit sa isang uri ng gamot.
Ginagamit din ang pagsubok ng genetic resistance kapag pinagdududahan ang mga gamot sa paggamot sa mga indibidwal sa therapy. Ang pagsusulit ay ginaganap habang ang pasyente ay alinman sa pagkuha ng nabibigyang pamumuhay o sa loob ng apat na linggo ng paggulo ng paggamot kung ang viral load ay mas malaki sa 500 kopya / mL. Ang genotypic testing ay karaniwang ginustong sa mga pagkakataon na mas mababa ang gastos nila, may mas mabilis na oras ng pag-turnaround, at nag-aalok ng higit na sensitivity para sa pag-detect ng mga mixtures ng wild-type at resistant na virus.
Ang isang kumbinasyon ng phenotypic at genotypic na pagsubok ay karaniwang ginustong para sa mga taong may kumplikadong, multi-drug resistance, lalo na para sa mga nakalantad sa protease inhibitors .
Pinagmulan:
World Health Organization (WHO). "Katotohanan sa HIV Drug Resistance Sheet." Geneva, Switzerland; Abril 11, 2011.
Kim, D .; Ziebell, R .; Saduvala, N .; et al. "Trend sa transmitted HIV-1 ARV drug-kaugnay na mutations na may kaugnayan: 10 mga lugar ng surveillance ng HIV, US, 2007-2010." Ika-20 na Kumperensya sa Retroviruses at Opportunistic Infections. Atlanta, Georgia; Marso 6, 2013; Oral abstract 149.
National Institutes of Health (NIH). "Mga Alituntunin para sa Paggamit ng Mga Antiretroviral na Ahente sa mga Matatanda at mga Kabataan na Nakaranas ng HIV-1." Bethesda, Maryland; Oktubre 11, 2013.